游宇宁

助理教授

校长青年学者
教育背景

博士(美国德州农工大学)

本科(西安交通大学)

研究领域
图机器学习;生成模型;面向细胞生物学的机器学习
学术领域
计算机工程
个人网站
港中大(深圳)个人网站
电子邮件
ynyou@cuhk.edu.cn
个人简介

游宇宁博士是香港中文大学(深圳)理工学院的助理教授。游博士于美国德州农工大学获得博士学位(2019-2024),于西安交通大学获得工学学士学位(2015-2019),并在加州理工学院进行博士后研究(2024-2025)。在2025年,游博士获得德州农工大学校友会颁发的研究生毕业生科研卓越奖。 游博士的研究专注于开发用于结构化数据模式分析的机器学习算法,包括图、点云和场数据——具体而言,他开发了一类被称为图自监督学习的算法,用于小分子、蛋白质接触图和单细胞的大规模图数据挖掘。通过利用这些算法,他致力于构建针对不同尺度生物组织的仿真器,包括分子、细胞、组织、有机体和临床应用——他最近构建了一个名为“虚拟组织”的仿真器,用于建模基因、细胞和微环境之间的复杂相互作用。这些仿真器作为有效的计算工具,在生命科学研究的广泛应用中发挥作用,例如药物发现。

学术著作

1. NeurIPS’20: “Graph Contrastive Learning with Augmentations”, Y. You#, T. Chen#, Y. Sui, T. Chen, Z. Wang, Y. Shen, Conference on Neural Information Processing Systems, pp. 5812-5823, 2020. (#Equal Contribution, Acceptance Rate 20.09%)

2. ICML’21 Long Presentation: “Graph Contrastive Learning Automated”, Y. You, T. Chen, Y. Shen, Z. Wang, International Conference on Machine Learning, pp. 12121-12132, 2021. (Acceptance Rate 3.01%)

3. Bioinformatics’22: “Cross-Modality and Self-Supervised Protein Embedding for Compound- Protein Affinity and Contact Prediction”, Y. You, Y. Shen, Bioinformatics, vol. 38(Supplement 2), pp. 68-74, 2022. (Impact Factor 6.93, MoML’22, ECCB’22 with Acceptance Rate 17.40%, 3DSIG COSI@ISMB/ECCB’21, MLSB@NeurIPS’20)

4. ICLR’23: “Graph Domain Adaptation via Theory-Grounded Spectral Regularization”, Y. You, T. Chen, Z. Wang, Y. Shen, International Conference on Learning Representations, oprev., 2023. (Acceptance Rate 31.80%)

5. ICLR’24: “Latent 3D Graph Diffusion”, Y. You, R. Zhou, J. Park, H. Xu, C. Tian, Z. Wang, Y. Shen, International Conference on Learning Representations, oprev., 2024. (Acceptance Rate 31.00%)

6. MLGenX’25: “Building Foundation Models to Characterize Cellular Interactions via Geometric Self-Supervised Learning on Spatial Genomics”, Y. You, Z. Wang, K. Fleisher, R. Liu, M. Thomson, Machine Learning for Genomics Explorations Workshop, International Conference on Learning Representations, 2025.